巴音郭楞職業技術學院，成立于2002年2月19日，是新疆維吾爾自治區人民政府批準設立的一所全日制、綜合性高等職業技術學院。該學院由原巴州財貿學校、巴州農校、巴州技工學校、庫爾勒市職業中專、庫爾勒市第十中學五所學校合并組建。2002年2月8日，自治區教育廳黨組通過并上報自治區人民政府批準設立巴音郭楞職業技術學院。同年2月19日，自治區人民政府正式批準成立巴音郭楞職業技術學院，標志著“華夏第一州”擁有了屬于自己的大學。
2002年2月26日，新疆維吾爾自治區教育廳副廳長薛健同志與巴音郭楞蒙古自治州黨委書記張志恒同志共同為巴音學院揭牌，學院正式宣告成立。
2002年4月22日，時任自治區人民政府主席的阿不來提·阿不都熱西提親臨巴州，在州委書記張志恒、州長巴代的陪同下，為學院新校區“巴音苑”破土動工剪彩。
2017年8月，學院被選為教育部第二批現代學徒制試點單位。
2019年10月，學院順利通過教育部現代學徒制第二批試點單位驗收。
以下是歷任院長名單：白永紅，2002年至2013年6月17日任巴音郭楞職業技術學院院長；馬懷立，2013年6月17日至2017年9月7日任院長；王貴忠，2018年3月12日至2020年2月18日任院長。
截至2020年2月18日，學校官網顯示，學院現有專任教師225人，涵蓋漢、蒙、維、回等七個民族，其中本科學歷者201人，高級專業技術職務者114人，“雙師型”教師43人。
截至2020年2月18日，學校官網顯示，學院緊密圍繞巴州石油石化、礦產、農副產品加工、棉花系列加工等五大支柱產業，設有電子信息工程學院、機械電氣工程學院、石油化工學院、人文經濟學院、傳媒學院、礦業工程學院、繼續教育學院、體育學院、生物工程系、紡織工程系、交通工程系、旅游系、基礎課教學部等8院4系1部。學院開設了53個中職專業和30個高職專業，其中畜牧獸醫是自治區重點扶持的特色專業，思想道德修養與法律基礎是自治區級重點建設課程。
學院致力于提升辦學效益，擴大高職教育規模，積極與國內外高校及知名企業開展聯合辦學。已與丹麥巴瑞?？茖W校、加拿大阿伯茲福特學院、俄羅斯卡爾梅克共和國、日本京都民際日本語學校等多家國外高校實現聯合辦學，雙方教師交流達10人次，5名學生赴丹麥留學。同時，學院與清華大學、新疆大學等20余所國內高等院校建立了合作關系。
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