黃水蓮（廈門衛生學校書記）王斌：自2006年9月至2015年12月26日擔任廈門醫學高等?？茖W校校長；吳小南：自2016年5月至2017年6月擔任廈門醫學高等?？茖W校校長；吳小南：自2017年6月至2020年1月29日擔任廈門醫學院院長。
廈門醫學高等?？茖W校成立于1953年9月，由閩南地區唯一的公立護士學?！獜B門護士職業學校、廈門醫士學校和廈門第二醫院護士學校合并而成。在“文革”期間曾一度停辦，1972年恢復辦學。2001年，經市政府批準，在學校成立廈門醫學高等?？茖W?；I建處，負責組建廈門醫高專。2002年，廈門醫高專通過省高校設置評審委員會考察，經省長常務會、省委常委會議決定，報教育部驗收，并于2003年秋季開始招生。2007年3月16日，中華人民共和國教育部同意在廈門衛生學?；A上建立廈門醫學高等?？茖W校。廈門衛生學校原為市屬中專。
2014年8月，學校啟動了502畝新校區的規劃建設。
2015年7月14日，廈門市人民政府辦公廳成立了廈門醫學院籌建工作領導小組。
廈門醫學院
2016年3月，學校獲得國家教育部批準，正式建立廈門醫學院。
截至2020年1月29日，學校官網顯示，現有專任教師302人，其中教授33人，副教授67人，占專任教師總數的33.1%；擁有博士學位的86人，碩士學位的154人，碩士學位以上占專任教師總數的79.5%；“雙師型”教師154人，占51%；兼職教師81人，占專任教師的26.8%。學校還擁有省級教學名師5人，省級專業帶頭人2人，省百千萬人才1人，省高校杰出青年科研人才3人，省百千萬工程領軍人才1人，廈門市臺灣特聘專家1人、臺灣特聘專才4人和臺籍教師2人。此外，學校擁有1個福建省教學團隊（高職高專）。
截至2020年1月29日，學校官網顯示，設有基礎醫學部、臨床醫學系、口腔醫學系、護理系、藥學系、醫學技術系、思想政治理論課教研部、體育教研部、外語教研部和心理健康中心等10個教學系部，開設15個本科專業和17個?？茖I。
截至2020年1月29日，學校官網顯示，學校已建立校企共建校內實踐教學基地4個（包括生物制藥、藥物制劑GMP車間生產性實訓基地、杰登義齒加工生產性實訓基地、福建國大藥房廈門醫學院校中店和廈門銘嘉眼鏡校中店），以及校外實踐教學基地147個（包括廈門市第一醫院等11家教學醫院和136家校外實習基地）。
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