學校發展歷程：
1909年，晚清郵傳部上海高等實業學堂（南洋公學）船政科創立，標志著中國高等航海教育的開端。
1912年，吳淞商船學校成立。
1928年，學校更名為吳淞商船?？茖W校。
1959年，交通部在滬成立上海海運學院。
2004年，經教育部批準，學校更名為上海海事大學，并整體搬遷至臨港新城。
2009年，中國高等航海教育及上海海事大學慶祝百年華誕，百年航海教育起源于上海。
2011年，教育部批準學校與加納中西非地區海事大學合作開展“物流管理”本科教育項目，并在非洲招生，這是上海地方高校首個在海外頒發中國高校本科文憑的項目。
2012年，學校被教育部正式認定為“接受中國政府獎學金來華留學生院?！?。
2013年5月，教育部評為“2012-2013年度全國畢業生就業典型經驗高?！?。7月，上海海事大學與上海交通大學簽訂共建協議。
2014年4月，上海海事大學研究生院成立。6月，入選教育部第二批卓越工程師教育培養計劃高校。
2016年12月，國際海事（中國）研究中心和聯合國國際海事組織（IMO）亞洲海事技術合作中心（MTCC Asia）設立于學校；學校發起成立全球航運智庫聯盟和中國物流高校聯盟；與上海振華重工（集團）股份有限公司、上海智能制造研究院共建“上海離岸工程研究院和海工智能制造聯合研究中心”，成為首家納入上海市功能型平臺建設的市屬高校。
2017年8月，認定為上海市首批深化創新創業教育改革示范高校。同月，與廣州南沙開發區簽訂戰略合作協議，并在南沙區舉行粵港澳大灣區供應鏈研究院揭牌儀式。
2018年6月，首批入選上海高等學校一流本科建設引領計劃。
2019年4月，首批入選上海高等學校一流研究生教育引領計劃。7月，與汕頭市人民政府簽訂戰略合作框架協議，并在汕頭市委大樓舉行“粵港澳大灣區供應鏈研究院粵東分院”和“上海海事大學灣區研究生院培訓基地”揭牌儀式。
上海海事大學歷任校（院）長：
陳嘉震：上海海運學院院長（1981.8-1983.12）；
陳希群：上海海運學院院長（1986.8-1991.12）；
沈康辰：上海海運學院院長（1992.1-1999.5）；
王宏彪：上海海運學院院長（1999.5-2001.10）；
於世成：上海海運學院院長（2001.10-2004.5）；
於世成：2004.5-2011.12.31任上海海事大學校長；黃有方：2011.12.31-2020.02.12任上海海事大學校長。
截至2020年2月12日，學校官網顯示，學校擁有專任教師1200余人，教授160余名，博士學位教師比例約為63%。
截至2020年2月12日，學校官網顯示，學校設有3個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程、管理科學與工程），4個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程、船舶與海洋工程、電氣工程），23個二級學科博士點，16個一級學科碩士點，60個二級學科碩士點，12個碩士專業學位授權類別，48個本科專業；擁有12個省部級重點研究基地；有1個國家重點（培育）學科，1個上海市高峰學科，2個上海市高原學科，9個部市級重點學科，工程學科進入ESI全球前1%；本科生16500余人，各類研究生近6000人，留學生近700名；專任教師1200余名。
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