哈爾濱理工大學有軟件學院等22個學院；自動化學院；電氣和電子工程學院；計算機科學與技術學院；應用科學學院；國際文化和教育學院；馬克思主義學院；研究生院；管理學院；技術與通信工程學院；經濟學院；榮成學院；建筑與工程學院；化學與環境工程學院；外國語學院；成人和繼續教育學院；藝術學院；預備役軍官學院；體育系；法學院；機械工程學院；材料科學與工程學院等。
哈爾濱理工大學專業為測控技術與儀器、工程力學、車輛工程、傳感器網絡技術、經濟學、金融學、國際經濟與貿易、電氣工程及其自動化、材料成型與控制工程、高分子材料與工程、對外漢語、哲學、微電子學、計算機科學與技術、通信工程、自動化、熱能與動力工程、軟件工程、化學工程與技術、安全工程、環境工程、無機材料工程、機械設計制造及其自動化、 機械電子工程、電子信息工程、電子科學與技術、網絡工程、集成電路設計與集成系統、建筑學、土木工程、制藥工程、公用事業管理、信息管理與信息系統、旅游管理、人力資源管理、會計學、市場營銷、工商管理、政治學與行政學、法學、統計學、信息與計算科學、材料化學材料物理、電子信息科學與技術、應用物理、光信息科學與技術、藝術設計、英語、日語、俄語、韓語、金屬材料工程、工業設計等幾十個本科專業。
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